多數佛教行者與學者認為穢跡金剛與火首金剛（或稱烏芻瑟摩 Ucchuṣma 明王）為同尊。但是，就緣起而言，火首金剛和穢跡金剛是有差別的，且真言咒語也不同。
穢跡金剛，即「清除穢跡金剛」之簡稱，唐代希麟法師明確稱之為「除穢憤怒尊」，又稱大權力士神王佛，為釋迦牟尼佛化現之金剛明王，本體為化佛。在佛法修持上，為密教本尊或護法，依漢傳密教、藏傳密教不同傳承有多種身形：二臂、六臂、八臂及靛藍、紅色、藍色、綠色等。唐密穢跡金剛像上頂有釋迦牟尼佛。
《楞嚴經》也有穢跡金剛
人們在決定修學穢跡金剛法前，應該先參考《楞嚴經》中所提到的二十五聖圓通法門，其中烏芻瑟摩的火大圓通法，化淫心爲智慧火，觀察身體的暖觸，因而證得火光三昧。
支持同尊的論據：
- 穢跡金剛的梵音是烏深目，與火首金剛的梵音烏芻瑟摩相近。
- 唐代希麟《續一切經音義·第七卷》曰：「烏樞瑟摩，梵語或云烏蒭沙摩，舊譯云穢跡金剛，此言有失，似毀於聖者也。新翻為除穢忿怒尊，謂以金剛慧，現威怒身，降伏難調穢惡有情故也。」將烏芻（/樞）瑟摩作為穢跡金剛的梵名。
持不同意見者：
- 在《穢跡金剛說神通大滿陀羅尼法術靈要門》中佛陀心光左旋化出穢跡金剛，
- 而，《大威力烏樞瑟摩明王經》中烏樞澀摩則是由金剛手菩薩應摩醯首羅天王大部多主所請，入「怖畏金剛大忿怒遍喜三摩地」所化出。
我個人的相信和主張是這樣的：
- 緣起不同，因此不能直接認爲是相同尊。因爲緣起不同，那麼“業用”就不相同。
- 既然，兩尊的真言咒語不同，那麼業用就有差異。而本尊瑜伽屬於業用性質，因此在非究竟的層面上不能視爲同尊。
- 若您想修拙火瑜伽，何不修穢跡金剛法？
漢傳穢跡金剛的緣起
釋迦牟尼佛臨入涅槃，四眾哀戚謁佛聞法。然而當時螺髻梵王在天上同諸天女娛樂，不來覲省佛陀聽法。當時有咒仙前去拿取梵王。被梵王用便溺淫血等穢物施法困住而咒術不靈；又有金剛神前去，亦被穢物困住。過了七天，梵王仍不來覲見佛陀。這時，佛陀心光左旋，化出一尊穢跡金剛，騰身空中，來到梵王所，一指穢氣就變成淨土，解救了咒仙及金剛神，並將梵王帶到佛前，螺髻梵王懺悔前罪，發心護持佛法。佛陀授記：於未來際，穢跡金剛成為「大權力士神王佛」，螺髻梵王成為「清淨光明佛」。
漢傳穢跡金剛法
- 福建鼓山派：持誦穢跡金剛咒，金剛杵上有四大天王、八大菩薩。
- 北京派：持誦穢跡金剛咒、一根本手印、四十二道符。
- 四川派：持誦穢跡金剛咒、六種手印、五鈷金剛杵修法。
著名道場
- 台灣新北市樹林福慧寺（北京派，唐密穢跡金剛根本道場）
- 台灣台北市大乘講堂（福建鼓山派，湧泉寺法脈）
- 香港芙蓉山虛雲老和尚紀念堂 （海燈法師傳承）
- 四川省彭州市九隴鎮（丹景山鎮）佛山古寺
- 香港青山佛教真言宗法界圓融派蓮池淨院（寶霞法師傳承）
- 菏澤虛雲佛學社（濟平法師傳承）
媽祖也修穢跡金剛法
北宋‧媽祖林默娘藉穢跡金剛咒(佛教密宗的咒語)修得神力
據耕雲居士著的《觀潮隨筆‧第一輯世說》書中說：媽祖皈依於大悲庵的淨光上人，淨光上人傳授媽祖以「綠度母觀音本尊」(佛教密宗本尊法)及「穢跡金剛」諸密法(佛教密宗的法)，並為專說大乘要義，兼授「三昧耶最上戒」(佛教密宗的戒律)，未幾修得神通，每為邑人驅邪治病，群咸目為神人，而救溺、導航、解海上危難，功德尤大。
若依阮昌銳《莊嚴的世界》說法，媽祖十六歲時，有一天與女伴在庭院休憩，忽然有神人從古井出，手執「銅符」，將「銅符」交給默娘後，升空而去。默娘潛心鑽研「銅符」的靈妙，學得一身法術，用「銅符」驅邪壓煞，消災解厄，治病濟世。
按：據聞一千年前媽祖在古井所得之「銅符」即「穢跡金剛符」。大悲庵 淨光上人傳授給林默娘 居士的是「綠度母觀音」及「穢跡金剛」等密法，所以媽祖才有此神力。
媽祖成道前也是修「綠度母觀音本尊」和漢傳「穢跡金剛」法。
修持《穢跡金剛法功德利益》四十二功德：
位尊德貴。降伏情慾。去染除穢。通染通淨。方便修學。聰明智慧。得大福報。離貧得富。降魔鬼病。延壽消災。治瘟疫病。治惡瘡病。療冷寒症。治百萬病。治夜驚怖。夜夢吉祥。令得安樂。滅諸罪事。畫像滅罪。防蛇毒獸。辟諸毒食。防水難患。止雹息雪。辟兵災橫。辟官諍訟。免除盜賊。治兒夜啼。眾神庇護。鬼神禮敬。諸王貴敬。金剛侍衛。子息易得。生產順利。得善姻緣。超渡解脫。見亡者事。本尊夢感。本尊相隨。證總持門。得宿命智。速獲菩提。授記作佛。
勤修後可得宿命智
算命先生修穢跡金剛法相當適合，這個密法不需要設壇，能得宿命智。且，北京派（臺灣根本道場在新北樹林福慧寺）持誦穢跡金剛咒、一根本手印、四十二道符。修習到了一定程度，功德足夠，四十二道符便可利益衆生。穢跡金剛禁百變法經（內有四十二道咒） https://cbetaonline.dila.edu.tw/zh/T1229
梵音 穢跡金剛咒（福慧寺欽因上師 誦）果濱居士恭錄
樹林福慧寺 穢跡金剛法之法脈傳承 https://fuhuisih.org/portfolio
【果濱梵音】漢傳穢跡金剛咒(梵音版)21遍
穢跡金剛咒梵音&悉曇體&咒義 果濱教學
穢跡金剛咒（大力法師）
瑜伽脈輪海底輪爲“地輪”，臍輪爲“水輪”。古井的符號（名相）意義可象徵“陳下丹”。
《大日經》胎藏界密法中“轉阿字”所用 a vam ram ham kham 觀想肉身爲法界塔婆，以及《瑜祗經》金剛界金剛吉祥大成就品中所說佛眼佛母根本咒 ah vi ra hum kham hum hrih ah (胎藏）以及 vam hum trah hrih ah (金剛界）根據我個人的理解，氣是由下丹循序往頭頂的，這和太極凌空勁從“肩井”提氣是相當有關係的。而肩井提氣和手印（密契）也是有原理關係的，因爲樞紐在肩井部。
上師瑜伽（上師相應法）的修法過程經常觀想上師從前額融入自己的身體中，這是觀想的方法之一，我個人的經驗認爲不一定需要這麼難。說這難，是因爲人們可能很難接受自己的身體被上師所“佔據”。這太難了！有的上師甚至還吸菸的習慣戒不掉，這你怎麼願意接受一個“煙鬼”融入你的身體呢？
所以佛眼佛母的根本咒可以解決“古井”的解脫問題。根據《大日經》，阿字門可以在身體的任何處產生開端，所以佛眼佛母的根本咒有兩個ah, 一個在最前面，一個在最後面，並且特別說了“眼”這個名稱，與“母”這個名稱。上丹下丹就在佛眼佛母根本咒的胎藏真言中陳述完了。差別是“實踐”。
跟我學過紫微斗數的同學大概會想到我說的“眼”是什麼，並且想要確定我在這裏所說的“眼”是不是“也指”什麼？
我的回答是：
Bhagavan 這個字就是你在佛經上“如是我聞”開場白後緊接着常常看到的”薄伽梵”這個詞，薄伽梵的意思就是“世尊”，世所尊敬者。這個字的字根是“媽媽的生門”。從哪兒來的，不從那兒回去，那麼是要回哪兒去？看看穢跡金剛的頭頂是什麼？擺在你頭頂的次序不要亂了！那是佛頂的次第！若你真心想學佛法，那麼你自己非常明白，你最願意擺在你頭頂的第一次序就是穢跡金剛頭頂的那一尊—— 若你不是這樣的次序，那麼你所說的“平等智”其實是在瞎掰。所以，想求法的話，先把頭頂的第一尊擺對了，那麼你才能找到對的“師父/老師/上師”。